Como todos los ferrocarriles mineros, la historia de este trazado es muy modesta. La riqueza en hierro de los montes situados junto a San Nicolás del Puerto hizo que unos avispados británicos, como solía ser habitual por aquellos tiempos, adquirieran los derechos de explotación de los filones a finales del siglo XIX. Para dar salida a la producción tendieron un ferrocarril que enlazaba con una cercana línea de tren de vía ancha situada 15 km. monte abajo, siguiendo el cauce de la Rivera de Huéznar.

En 1895 se iniciaron y concluyeron las obras de este ramal que, a diferencia de otros ferrocarriles mineros, se realizó en vía ancha lo que facilitaba las labores de explotación de la línea, concedida a la empresa MZA (Compañía Madrid, Zaragoza y Alicante) y luego a Renfe, titulares de la línea general situada en el fondo del valle.

Nunca tuvo servicio de viajeros ni de otras mercancías que no fueran las propias de la mina, a pesar de los varios intentos y el gran interés de los municipios por donde atraviesa su trazado. Finalmente, es en 1970, mediante Circular al personal de la Red de Ferrocarriles Españoles, cuando se cierra el Servicio en el Ramal de Bifurcación del Río Huéznar al Cerro del Hierro, señalando que se mantendrán por el momento, las instalaciones y la vía hasta que pueda decidirse sobre su desmantelamiento a razón de una posible y futura reactivación de las explotaciones mineras a que servía este ramal, cosa que no pasó nunca.